Download TranspoGene and microTranspoGene Tables

Exonized TEs: Human exonized TEs (hg17 positions) Human exonized Tes (hg18 positions) Mouse exonized TEs (mm6 positions) Mouse exonized TEs (mm9 positions) Zebrafish exonized TEs Chicken exonized TEs Nematode exonized TEs (ce2 positions) Nematode exonized TEs (ce4 positions) Exonic TEs Human exonic TEs (hg17 positions) Human exonic TEs (hg18 positions) Mouse exonic TEs (mm6 positions) Mouse exonic TEs (mm9 positions) Zebrafish exonic TEs Chicken exonic TEs Fruit fly exonic TEs (dm2 positions) Fruit fly exonic TEs (dm3 positions) Nematode exonic TEs (ce2 positions) Nematode exonic TEs (ce4 positions) Sea squirt exonic TEs

Intronic TEs

• Human intronic TEs (hg17 positions)
• Human intronic TEs (hg18 positions)
• Mouse intronic TEs (mm6 positions)
• Mouse intronic TEs (mm9 positions)
• Zebrafish intronic TEs
• Chicken intronic TEs
• Fruit fly intronicic TEs (dm2 positions)
• Fruit fly intronicic TEs (dm3 positions)
• Nematode intronic TEs (ce2 positions)
• Nematode intronic TEs (ce4 positions)
• Sea squirt intronic TEs

Promoter TEs

• Human promoter TEs (hg17 positions)
• Human promoter TEs (hg18 positions)
• Mouse promoter TEs (mm6 positions)
• Mouse promoter TEs (mm9 positions)
• Zebrafish promoter TEs
• Chicken promoter TEs
• Fruit fly promoter TEs (dm2 positions)
• Fruit fly promoter TEs (dm3 positions)
• Nematode promoter TEs (ce2 positions)
• Nematode promoter TEs (ce4 positions)
• Sea squirt promoter TEs

microTranspoGene

• MicroRNA precursors structurally derived from TEs
• Human microRNA precursors transcribed ny RNA pol III using Alu promoter/terminator

Gene tables used in TranspoGene

• Human hg17 known genes (filtered table)
• Mouse mm6 known genes (filtered table)
• Zebrafish danRer4 Refseq genes
• Chicken galGal3 Refseq genes
• Fruit fly dm2 Refseq genes
• Nematode ce2 Refseq genes
• Sea squirt ci2 Refseq genes